芒砀山劫案引出梁山与朝廷的暗战
朝廷为追查元祐党宝藏，特意押解一批所谓的元祐党人前往徐州境内，准备借他们之手寻找埋藏多年的宝物。芒砀山寨主樊瑞得知此事后，立刻意识到这是一次难得的机会，便派人劫下寻宝队，打算把截获的藏宝图当作投奔梁山的见面礼。与此同时，梁山方面也派出公孙胜赶来徐州，目的正是营救这些元祐党义士。可公孙胜赶到时，寻宝队早已被樊瑞抢先拿下并押回山寨。樊瑞见来者是梁山好汉，顿时大喜，连忙献上自己夺来的藏宝图，表明投靠之意，没想到公孙胜展开一看，竟发现这张图根本就是假的。
梁山众人随即逼问樊瑞交出元祐党义士，樊瑞却一无所知，恼羞成怒之下与梁山好汉大打出手。双方一番交锋后，公孙胜布下石头阵，成功将樊瑞擒住。经过审问，公孙胜才得知，这支所谓的寻宝队压根就不是元祐党义士，他们其实只是被人雇佣来办事的。
真假藏宝图背后藏着知府侯占的阴谋
随着线索逐渐浮出水面，真正的真相也终于显现出来。原来，真正的寻宝队早就被徐州知府侯占灭口，而侯占则暗中派出手下，按照藏宝图秘密前去寻宝。那些真正的元祐党义士，也早已被侯占囚禁起来，根本不在樊瑞手中。更让人震惊的是，故意向芒砀山放出消息的人，正是知府侯占本人。他早已设计好一整套圈套，就是想借樊瑞的手制造混乱，再把所有罪名都推到芒砀山头上。
为了顺利挖开藏宝地点的山洞，侯占还故作玄虚，特意弄走一队囚犯，随后再把这件事嫁祸给樊瑞，让外界误以为是山寨劫走了朝廷人马。公孙胜很快分析出整件事疑点重重，判断这明显是一场精心布置的陷阱。樊瑞虽然一开始与梁山站在对立面，但在得知自己可能是被人利用后，也决心查明真相，以证明自己的清白。
公孙胜借左御使之手层层逼近真凶
就在此时，朝廷派来的左御使奉命前往徐州调查寻宝队失踪一案，却被侯占用计蒙蔽，误以为寻宝队是被芒砀山的混世魔王樊瑞劫走。公孙胜看准这一点，决定从左御使身上下手，寻找元祐党义士的下落。他施展手段接近左御使，逐步取得对方信任，为后续调查埋下伏笔。
另一边，樊瑞也顺着一连串蛛丝马迹追查真相，终于逐渐锁定幕后黑手就是知府侯占。可他在调查过程中不慎打草惊蛇，惊动了对方。侯占为了除掉后患，特意在凤仙楼设宴邀请左御使，表面上是款待朝廷来人，实际上却是想引樊瑞现身，好将其一并灭口。樊瑞果然上钩前往，幸好公孙胜及时出手，以巧妙手段加以阻止，才让樊瑞得以脱身。
牢房瘟疫与宝藏机关牵出更大真相
公孙胜随后探听到一个关键消息：牢房中出现瘟疫，因此被全面封锁。这个异常情况立刻引起了他的警觉，他与樊瑞当即把调查重点转向牢房。为了将功补过，樊瑞主动请缨，要求亲自去牢房探个究竟。两人约定，一旦发现异常，就用信号弹互相联络，以便及时支援。
事实上，侯占派去挖宝的囚犯已经被山洞落石砸死，这让侯占意识到藏宝地必然存在机关。为了继续掩人耳目，他索性封闭牢房，暗中继续向藏宝地点输送人手，并强迫元祐党人前去破解机关。樊瑞混入囚犯队伍后，被侯占手下带往真正的藏宝地点，终于在那里见到了被囚禁已久的元祐党义士。他抓住时机，悄悄放出信号弹，向公孙胜和梁山通报方位。
随后，樊瑞在藏宝地与侯占手下展开周旋，一边拖延时间，一边设法救人，最终成功将身处险境的元祐党义士救出。然而，众人很快遭到侯占手下的围攻，局势一度万分危急。就在关键时刻，梁山兵马及时赶到，联手解围，彻底扭转战局。
真相大白，樊瑞投奔梁山
与此同时，准备启程回京、打算上奏此案的左御使，也被公孙胜巧妙留下。公孙胜并未直接点破全部真相，而是通过暗示让左御使意识到藏宝之地另有玄机。左御使带兵赶到藏宝地点后，看到现场被捆绑的侯占手下，终于明白整件事从头到尾都是侯占在幕后操纵。面对铁证如山，左御使当即下令将侯占等人押送京城审问。
直到这时，樊瑞才真正看清全局，也明白若非公孙胜留住左御使，侯占的罪行未必能够公之于世。他对公孙胜感激不尽，心中的疑虑与隔阂也随之消散。经过这一连串生死考验，樊瑞彻底认清了梁山好汉的义气与担当，最终心悦诚服，拜公孙胜为师，投奔梁山而去。至此，一场围绕元祐党宝藏展开的阴谋被彻底粉碎，知府侯占的罪行也终于暴露在天下人面前。